«Lo vi ayer en la tele. Por lo visto, las gentes de la antigüedad cuando enfermaban se comían ese órgano de otro animal. Si tenían el hígado enfermo se comían un hígado y si tenían el estómago enfermo, se comían el estómago y de este modo se creían que se curaban». Con esta conversación da comienzo la relación de amistad entre Haruki y Sakura, compañeros de clase que empiezan a trabajar juntos como encargados de la biblioteca de su instituto. Haruki es un chico reservado y pesimista que no habla con nadie mientras que Sakura es tan vivaz y alegre que todos en la clase la quieren. Un día en el que ambos acuden de manera independiente al hospital, quedan conectados para siempre por «Mi enfermedad y yo», el diario de Sakura.
«Quiero comerme tu páncreas» es un manga, que es como se denominan los cómics en Japón. Este manga ha sido adaptado primero al cine con actores reales y luego se ha realizado una película de animación
A Sakura le queda poco tiempo de vida y decide escribir un diario para aceptar su destino y convivir con la enfermedad. La enfermedad que padece en el páncreas hasta hace poco causaba la muerte en muy poco tiempo, pero en la actualidad le permitirá vivir algunos años. Haruki, tras encontrar accidentalmente su diario, se compromete a guardar su secreto y aunque en un principio decide tomárselo estoicamente – a Haruki no le importa la gente, solo sus libros – en poco tiempo acaba completamente entregado en acompañar a Sakura el tiempo que le queda.
El páncreas es un órgano interno situado cerca del estómago, al que segrega sustancias para realizar la digestión y obtener energía
La amistad entre ambos va dando pasos a medida que juegan a verdad o reto, un juego que utiliza Sakura para que ambos muestren sus sentimientos y hagan cosas para vencer el pudor adolescente que les embarga. Aunque Sakura y Haruki, a lo largo de sus aventuras juntos, van haciéndose a la idea de la muerte de Sakura, sucederá algo que precipitará un final inesperado.